鹤”号、“翔鹤”号3艘航空母舰，“比睿”号、“雾岛”号两艘战列舰，以及“利根”号、“筑摩”号两艘重巡洋舰外，机动部队的其余舰只都需要在海上加油。在此之前，已经对油船的拖拽加油装置进行了紧急改装，并抓紧利用风浪天气进行了海上加油训练。
另一方面，为了提高续航力，舰内所有空地包括通道都堆满了装满柴油的油桶。柴油桶在舰内堆积如山。为了节省每一滴柴油，规定了严格的用油制度，照明灯数减少了，淡水不得浪费，舰员不得洗澡。这样，万一风浪很大，不能在海上加油时，各舰可以在进行空袭之后保持返航一半航程的续航力（航至东经160度一线）。另外还考虑到如果遇到异常恶劣的风浪天气，为了安全，不得不把油桶扔到海里的时候，至少可以保证部队行驶到脱离美军作战飞机活动半径的范围。
万一风浪天气连续不断，确实无法在海上加油时，准备让警戒部队中途返航，由机动部队单独冲锋陷阵。总之，舰队只要到达飞机起飞地点，就可以向珍珠港发动攻击。设法把飞机平安无事地运到起飞地点，这就是机动部队压倒一切的任务。
3。舰载飞机起飞地点
飞机从航空母舰起飞的地点离珍珠港越近越好。虽然离珍珠港越近越容易被敌人发现，但离得太远的话，飞行时间长，会增加飞行员的疲劳，影响鱼雷攻击和轰炸的命中率，而且在完成攻击后返航也比较困难。特别是缺乏海上飞行经验的战斗机，在飞行距离长的情况下要单独返航将极为困难。另外，如果需要对珍珠港进行反复攻击，还必须考虑到缩短路途上的飞行时间。从各种角度权衡考虑，最后决定起飞地点在瓦胡岛以北200海里。飞行队以每小时230公里的速度飞行，从飞机起飞后在上空集合到飞抵目标，大约需要两小时。
4。起飞时间
由于第5航空战队编入机动部队，实施拂晓攻击有了困难，乃把拂晓攻击改成白天攻击，即在日出前1小时从航空母舰起飞。12月上旬，檀香山日出时间大约是7时（东京时间2时30分），因此将起飞时间预定为X日（X日即为实施攻击的开战日，当时还未确定具体日期）的6时正（东京时间1时30分）。
5。攻击目标
从空袭珍珠港的作战目的来说，主要攻击目标自然是美国太平洋舰队的主力，即航空母舰和战列舰。当时，日本海军准确地知道，美国在夏威夷方面有“列克星敦”号、“约克城”号、“大黄蜂”号和“企业”号4艘航空母舰。还得到情报说，“萨拉托加”号航空母舰正在美国西海岸圣地亚哥军港修理，估计一个月后竣工。至于战列舰，据信，在夏威夷方面有八艘，即“西弗吉尼亚”号、“马里兰”号、“加利福尼亚”号、“田纳西”号、“亚利桑那”号、“宾夕法尼亚”号、“内华达”号和“俄克拉荷马”号。以上4艘航空母舰和8艘战列舰被列为主要攻击目标。
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偷袭珍珠港 第三部分（4）
为了从空中准确识别美国舰艇，日军机动部队的飞行员事先不厌其烦地进行了不计其数的训练。各飞行队都备有美国各种军舰模型，飞行员利用训练间隙，从纵横面、自上而下以及斜角进行反反复复的观察。譬如，哪一艘军舰有几个烟囱，舰桥在左舷还是右舷，是笼式桅还是三角桅等，飞行员甚至连做梦也在琢磨。他们对本国舰船的识别能力很差，但识别美国舰船，特别是航空母舰和战列舰，则万无一失。
有一段小小的插曲很能说明问题。日本的“瑞鹤”号和“翔鹤”号这两艘航空母舰外形很相似，简直无法区别。在一次演习时，一位飞行员误把“翔鹤”号当成了“瑞鹤”号，直到降落后才知道弄错了。那个飞行员说 ：“要是美国航空母舰，准不会弄错哩！”惹得大伙哄堂大笑。
日本人的目标是干掉美军的12艘主力舰，或者至少干掉其中一半，以使美国太平洋舰队一年左右，至少是半年左右无法行动。这绝不是一件轻而易举的事。如果美国舰队是在海上航行，或停泊在很深的海域，可以一举把美舰击沉，使它埋葬于海底藻丛之中。但现在的问题是，美军舰队停在修理设备完备的军港里。那里水深只有10米。如果美舰吃水7米，只要下沉3米就接触海底，不会再往下沉了。被炸的美舰“下沉到海底”后，如果倾斜不厉害的话，甚至舱面甲板有可能沾不到海水，用不着费多大劲就可以打捞上来。如果不将美舰彻底炸毁，这些舰艇很快便可以修复出海。所以，必须把美舰彻底炸毁才行。
根据机动部队可用于进攻的飞机的数量，究竟同时攻击几艘美舰合适呢？这必须根据可能达到的攻击效果决定。
首先看鱼雷攻击。鱼雷机队一共是40架飞机，使用的鱼雷重800公斤，其中炸药量约200公斤。要使战列舰或航空母舰这样的大型军舰受到致命打击，至少需要命中3条鱼雷，以便破坏它的水下部分，使它倾覆。40架鱼雷机对在泊美舰实施超浅海区鱼雷攻击，究竟能有多大命中率呢？考虑到有一些鱼雷机可能被美军的高射炮火击落，有一些鱼雷机在攻击过程中可能会受到美军飞机或地面高射炮火的干扰，最多只能达到60％的命中率，即命中24条鱼雷（每架鱼雷机只能携带一条鱼雷）。以一艘舰需要命中3条鱼雷计算，如果目标分配得当，可以击沉8艘。鱼雷机队的40架飞机共分为8个中队，其中，六机编队的中队4个，四机编队的中队4个。每个中队选定一个攻击目标就可以了。鱼雷机队就这样安排了对4艘航空母舰和4艘战列舰的攻击。
其次是判断水平（高空）轰炸的效果。水平轰炸机队共计50架飞机，以五机编队编成10个中队。投弹高度确定为3000米的中等高度。水平轰炸效率比较差，轰炸程序死板，预计水平轰炸机队会受到相当损失。实施水平轰炸时，进入轰炸航向后，犹如辕马上套，驾驶人员绝不能东张西望。五机编队各机之间要保持一定距离，以等高度和等航速组成严整的队形。向导轰炸机的驾驶员需要有高超的技巧，及时修正航向，不能有一丝之差。编队由向导轰炸机的投弹瞄准手引导，稳当地接近目标，一起投弹（当时的投弹装置还不是电动的）。后续轰炸机必须在向导轰炸机投弹的一刹那，拉动投弹索。这要有硬功夫才行。比如，第二架和第三架轰炸机的投弹时间不得迟于向导轰炸机投弹时间的秒，而第四架和第五架则不得迟于秒，只有这样才能使炸弹的落点覆盖目标，保证大致可以有1颗炸弹命中。按这种方法计算，以五机编队为一个攻击单位时，5颗炸弹中有一颗命中。考虑到有的中队不一定能捕捉到目标，因此大致上只能保持80％的捕捉率，即只有8个中队能够命中目标，每个中队命中一颗炸弹，一共命中8颗炸弹。
水平轰炸是使用800公斤穿甲炸弹，所以，一旦命中，效果很大。这种炸弹装有延迟时间为秒的延期引信，能够穿透战列舰的装甲，使炸弹在舰内爆炸。因此，即使炸药量不太大，但一旦在弹药舱附近爆炸，就会引起大爆炸，那就真的把敌舰“轰沉”了。但是，并不是每枚穿甲弹都能引爆敌舰的弹药舱（袭击珍珠港时，只有“亚利桑那”号战列舰的弹药舱被命中一颗穿甲炸弹，引起了弹药舱爆炸），因此，要使一艘战列舰受到致命打击，大体需要命中两颗800公斤炸弹。这就是说，水平轰炸机队可以搞掉4艘美国战列舰。
偷袭珍珠港 第三部分（5）
按照这种计算方法，如果——切顺利，只需40架飞机的鱼雷机队和50架飞机的水平轰炸机队，就可以给予美国太平洋舰队的主力——12艘大型军舰以致命打击。不过，在实际战斗中，目标的分配和转移往往不可能都像事前安排的那样得以实现。
参加轰炸的还有俯冲轰炸机队。由于要实施俯冲攻击，所以俯冲轰炸机不能携带重磅炸弹，每架只能携带一颗250公斤普通炸弹。空袭珍珠港时，俯冲轰炸机将从4000米高度开始俯冲，为了获得较高的命中率，当高度达到大约400米时开始投弹。这样，可以把命中率提高到80％以上。但是，俯冲轰炸机最容易被击落，如果将这一因素考虑进去，预计可能有50％的炸弹击中目标。俯冲轰炸机队一共81架飞机，取其半数，大约有40颗命中弹。
不过，俯冲轰炸机携带的250公斤普通炸弹，不能穿透战列舰的装甲，即使命中，也无非擦伤而已。但如果用它轰炸航空母舰，效果则就不同了。航空母舰结构单薄，俯冲轰炸可以给予致命打击。因此，俯冲轰炸机将全力以赴对付航空母舰。如果兵力有余，或者美军的航空母舰不在港内，就将按巡洋舰、战列舰的次序，选择攻击目标。如果战列舰在遭到鱼雷攻击后倾覆，没有装甲的水下部分露出水面，这时再用俯冲轰炸就能把敌舰彻底炸毁，使它无法修复。
通过周密计算和反复权衡，最后决定所有参加轰炸的飞机共组成两个攻击波，第一攻击波由鱼雷机队的40架飞机和水平轰炸机队的50架飞机组成，第二攻击波由俯冲轰炸机队的81架飞机组成，总共有171架飞机参加轰炸。这是对美国太平洋舰队主力实施攻击的基干兵力。
6。夺取制空权
如果仅仅使用上述171架飞机，是很难完成作战任务的。为了充分发挥基干兵力的攻击能力，必须有效阻止美军战斗机的反击，确保战斗空域制空权的掌握。这一任务，由另外的189架作战飞机去完成。
根据日军掌握的情报，瓦胡岛上的美军航空基地情况如下：
在瓦胡岛，美国陆海军共有6个机场。海军有福特岛机场、卡内欧黑机场和巴尔伯兹角机场，陆军有惠勒机场、希卡姆机场和佩洛斯机场。它们都地处能够保卫珍珠港的位置。
福特岛机场包括水上和陆上两个机场。水上机场驻有大型水上飞机，其主要任务是实施远程巡逻。陆上机场主要是太平洋舰队所属航空母舰舰载机的常驻基地。
卡内欧黑机场也包括水上和陆上两个机场。水上机场驻有水上飞机。陆上机场正在施工，竣工后可配备战斗机队。
巴尔伯兹角机场是一个舰载机有时进行训练的作业基地，没有机库。
惠勒机场是一个大型陆军战斗机机场。
希卡姆机场是陆军重轰炸机大型机场。
佩洛斯机场过去是陆军飞机作业基地，有时用于训练，从9月后升格为战斗机基地。
为了确保制空权，决定使用俯冲轰炸机队，趁美军战斗机还未起飞之际，对机场进行轰炸，制空战斗机队负责扫荡并击落起飞的美军战斗机。争夺制空权的189架飞机也分为两个波次。
第一波的俯冲轰炸机队54架飞机分为3个攻击队，将同时攻击驻有战斗机的惠勒机场及福特岛机场和驻有重轰炸机的希卡姆机场，并速即予以火力压制，以防止美机进行反击。福特岛机场和希卡姆机场离珍珠港很近，要求在攻击这两个机场时，不要让硝烟妨碍其他部队对珍珠港内舰船的攻击。
为了进一步扩大战果，第二波的水平轰炸机队共54架飞机也分为3个攻击队，继续对希卡姆机场、福特岛机场和卡内欧黑机场进行轰炸。这些水平轰炸机主要携带250公斤和60公斤炸弹。
为对付美军伺机起飞的战斗机，制空战斗机队也分为两个波次。第一波制空战斗机队由45架战斗机组成，第二波由36架战斗机组成。制空战斗机队将首先歼灭起飞的敌机，确保制空权，然后对各机场进行扫射。
偷袭珍珠港 第三部分（6）
以上是参加这次空袭的总共360架飞机所分配的攻击目标。为了保卫机动部队本身，每艘航空母舰将留下三分之一的战斗机在舰队上空巡逻，进行掩护。
7。搜索和警戒
在作战中先发现敌人，能取得主动权，获取先机之利。在珍珠港作战中，这一点显得尤其重要。如果美国舰队察觉日方意图并前来堵击，而日方搜索机先行发现敌人的话，就有可能在海上一举歼灭美国舰队。因此，在研究讨论中特别强调了搜索和警戒。
“伊－19”号、“伊－21”号和“伊－23”号3艘潜艇，将在机动部队航路前方大约200海里的地方进行搜索和巡逻。另外，第3战列舰战队（“比睿”号和“雾岛”号）和第8巡洋舰战队（“利根”号和“筑摩”号）搭载的共四架95式水上侦察机，将在机动部队周围大约160海里范围内，实施搜索和警戒。
作战中一个最重要的问题，是对珍珠港的预先侦察。袭击珍珠港如果扑空，就将前功尽弃。平时，美国太平洋舰队出入珍珠港频繁，在港内停泊的情况是很少的。况且，日