沙·格雷对贝尔的专利提出质疑。贝尔了解电话发明的全过程，曾经为它夜以继日地勤奋工作，对这种诬蔑性的质疑他准备斗争到底。
由于大部分诉讼发生在华盛顿，贝尔一家搬到了那里。他一次次被叫到法庭作证，早期记录的手稿成了重要证据。这场持续11年之久的诉讼成了美国历史上历时最长的专利诉讼案。证据已经足够了，贝尔按时间顺序记录下发明过程的资料，令人不得不信服他是真正的电话之父。另外，还有一个重要的证据是格雷寄给贝尔的信，它进一步证明了这个事实。伴随电话技术的改进，还出现了其他的专利纠纷，但是贝尔最终赢得了这一场斗争。
随着专利的明确，电话公司在哈伯德和桑德斯的得力管理下发展迅速。然而贝尔对生意既没有头脑也没有兴趣，他热衷的是对聋哑人的教育。尽管这是一项艰难的工作，有时甚至是徒劳的，但他执著于此，而且还有一些特别的技巧。他认为聋哑儿童应该和正常的孩子一起上学，相互交流，这样他们能更好地融入社会。贝尔的理论遭到了爱德华·高勒德的反对。爱德华的父亲是教育听力缺陷者的先锋，华盛顿著名的高勒德学校就是以他的名字命名的。爱德华认为手语是最主要的交流方式。贝尔不同意，认为这样会使聋哑人更加孤立。他们互不相让，都担心对方会利用聋哑人社群的影响来削弱自己的教育方式。为证实自己的理论，贝尔建立了一所学校以使用他的教学方式，后来因为找不到足够称职的老师，学校以失败而告终，这成为他一生中最痛苦的经历之一。
灾难接踵而至。1880年，贝尔和梅布尔有了第二个女儿，但是在1881年他们的第一个儿子出生之后就死了，第二个儿子1883年出生，却患有先天性呼吸道疾病。贝尔曾经看着两个兄弟死去而无能为力。现在他又一次感到绝望，孩子最后还是死了。作为一名科学家，那种无奈和痛心使他将注意力转移到了科研上。他发明了“真空服”，能帮助有呼吸障碍的人，这对他的儿子来说已经太晚了，但此发明成了人工呼吸器的前身。