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泛绿阵营与民进党泛绿联盟大致由民进党、台湾团结联盟与建国党组成，它主张台湾本土化、主权意识。泛绿阵营中的民进党成立于 1986 年 9月 28 日，是依靠反对国民党专制独裁、追求民主自由、主张“台湾独立”的各股“党外”势力合组建成“民主进步党”（简称民进党），打破了国民党长期“一党专制”的局面。民进党成立后，一直稳步发展，并在 2000 年 3月的“总统”选举中，因国民党阵营的分裂而渔翁得利，一夕之间成为执政党。
民进党自成立后，自 1989 年首次参选后，民进党的得票率一直稳步增长。目前民进党在“立法院”所占的席次为 87 席，为“立法院”第一大党。在 1986年民进党成立之初，民进党的党员人数仅有 1万余人，在 1995 年发展为 8万余人，1999年发展到 20 余万人。目前已突破 41 万。在 1986 年民进党成立之初，民进党的民意认同度仅有 7％ ，1996年升为 15％，在上台前一直维持在 20％左右。但是上台后，其民意支持度一直维持在 23％…29％之间，居于国、亲两党之上，成为岛内第一大党。
民进党自成立之日起，其“台独”倾向就已显露。1986年 11 月，民进党“一大”通过党纲，提出“台湾前途应由台湾全体住民自决”的原则；1987年，民进党“二大”将“台湾人民有主张台湾独立的自由”写进大会的决议；1988年4 月，“二大临时会”进一步称“台湾国际主权独立”，提出了“如果国共片面和谈，如果国民党出卖台湾人民利益，如果中共统一台湾，如果国民党不实行真正的民主宪政，则民进党主张台湾应该独立”。1989年，民进党又希望以“独立的政治实体为考量的准两国两府模式”来为台湾定位；1990年的“四大二次会议”，民进党再次以决议方式通过“我国事实主权不及于中国大陆及蒙古”。
1991年 8月 24 日至 25 日，民进党借“人民制宪会议”的机会，提出“台湾共和国宪法草案”，将“国号”命定为“台湾”并以“事实主权”的原则规范台湾的领土范围，明订台湾的领土变更，“应该依照当地住民自决原则，并经国会决议通过”等。28日，民进党中常会讨论通过了该“草案”。这部公开打出“台湾共和国”旗号的“宪法草案”的出笼，向世人昭示，民进党不仅要争夺台湾的统治权，而且要使台湾从中国分离出去。同年 10 月 13 日，该党“五大”又通过“台独”主张列入党纲修正案。11月 12 日，许信良就任民进党第五任党主席并发表演说，短短的几年，民进党从纲领到行动，已成为一个彻头彻尾的“台独党”。
民进党成立以来，随着国际形势和台湾岛内形势的变化，尤其是国民党“宪制改革”，使“台独”势力取得了结社自由，生存发展空间有所扩大，作为岛内“台独”主导力量的民进党，在“立委”选举和“省市长”、县市长等地方选举中取得了不少席位，在 1996 年总统选举中也得到不少选票，成为台湾政坛上一支不可忽视的制衡力量。“台独”活动也已由地下转到街头，由隐蔽走向公开，由海外转向岛内。
从台湾光复一直到本世纪 70 年代末 80 年代初，由于国民党对“台独”活动采取严厉打击的政策，致使“台独”在台湾岛内几乎没有生存的空间。那时他们的活动是地下的、隐蔽的，且都在海外活动。1986年以来，“台独”分子以“结社自由”、“言论自由”为幌子，公开拉帮结伙和参加各种选举，其活动由地下转到地上，由隐蔽走向公开。后台湾当局又对“刑法 100条”和“国家安全法”等有关法规作了修改，以及李登辉对“台独”的宽容和搞“一中一台”的分裂活动，不仅为海外“台独”分子回台敞开了大门，也使“台独”势力在岛内的活动合法化。海外“台独”组织“台独联盟”、“台湾人公共事务协会”、“台湾民主运动海外组织”等乘机将主要力量转移到台湾；海外的“台独”活动已明显减少，其活动的中心主要集中在岛内。
夺取国民党政权一直是“台独”势力活动的主要目标之一。他们宣称要在本世纪结束夺取国民党政权，使国民党成为在野党。为此，民进党发表“国是建言”，提出“总体建国方略”，从“宪政改革”、“国家定位”、“两岸关系”、“六年建国”、“地方自治”、“社会福利”诸方面，系统地阐述对各项政策的主张，实际上提出了一个完整的“夺权纲领”。在 1997 年底的县市长选举中，民进党夺得了 12 席县市长职位，不仅在总席次和得票率上首次超过了国民党，更重要的是所执政县市总人口占全部的 71。59％ ，地方税收占 83。12％ ，地方总预算占69。24％，成为地方政权的“第一执政党”，对国民党的执政地位构成直接威胁。
民进党吸取了 1991 年二届“国代”选举失败的教训，不再刻意凸显“台独”或“台湾共和国”字样，淡化“台独党”形象，于是打出“一中一台”的旗号，叫嚷“台湾是台湾，中国是中国”。在 1992 年底的二届“立委”选举中，改用“一中一台”作为诉求。民进党先后公布了《宪政体制改造政策纲领草案》、《现阶段两岸关系与对中国政策》、《民主进步党的外交政策》等 10 余个政策性文件，合称“公共政策白皮书”。它涉及到“宪政改革”、“大陆政策”、“国防”、“外交”、“经济发展”等 12 个方面，比较全面的勾勒出其未来的“施政蓝图”。在 1992 年的二届“立委”选举中，民进党以公共政策为主要诉求，提出“三反三要”口号，即“反军权、反特权、反金权、要减税、要（”总统“）直选、要（台湾）主权”。
民进党成立之初是反国民党政治势力的联合体，是在野政治明星及地方山头的结合体。由于各领导人政治阅历及社会、经济基础的不同，彼此在政治观念、运动路线等方面存有较大的分歧，形成形态各异的诸多山头派系。主要有党外编联会人马形成的新潮流派系，党外公政会中“美丽岛连线”人马形成的美丽岛系，还有原党外公政会的康系、前进系和超派系等。随着台湾政治形势的发展，各派系势力不断变化，并重新分化组合，康系瓦解，分别被美丽岛系和新潮流系所收编，前进系亦并入美丽岛系。
民进党内新潮流派与美丽岛系两大派系在运动目标、斗争路线，以及国民党政权性质和台湾前途走向等方面都存在着程度不同的歧异，某些甚至严重对立，斗争异常激烈。美丽岛倾向于温和的体制内抗争，主张对政治民主化的追求优先于“台湾独立”；而新潮流派系强调对国民党统治体制的抗争和群众运动路线，主张对“台湾独立”的追求优先于政治民主化。
美丽岛系人数众多、组织涣散、各自为战，成员没有纪律约束，内聚力较差，只有在党内资源重新分配时，才体现出整体运作能力。而新潮流系人数虽少，但以理念作为结合的基础，组织严密，纪律严格，凝聚力强，近年来逐渐到达了控制党权的主导地位。美丽岛系对新潮流系掌握中央权力不满。特别对民进党上层抱持“台独”立场不放持有异议，认为民进党的“台独党”形象严重地影响了民进党得票率的提高，是该党执政的绊脚石。他们宣扬“执政优先论”，主张与在野势力和部分国民党力量结合，早日分享权力。此外，两派在对待“李登辉情绪”、与新党“大和解”、对大陆政策等一系列问题上也存在着严重的分歧。
追求“台湾主权独立”始终是民进党为之奋斗的基本目标。其政策主张具体有：两岸关系方面：民进党自年成立之日始就带有严重的分离倾向，声称“台湾前途应由台湾全体住民共同决定”，并于1991年将“建立主权独立自主的台湾共和国基本纲领”列入党纲，叫嚣“独立建国、制定新宪，依据国际法原则重返国际社会”，“两岸依据国际法在国与国的关系下发展关系”等等，蜕变为地地道道的“台独党”。
在岛内外各种局势的影响下，民进党近年来对“台独党纲”进行了一些淡化处理，并于 1999 年 5月 8日提出了所谓的“台湾前途决议文”，逐步由过去叫嚣“建立新而独立的国家”转变为鼓吹“维持现状就是独立”的“事实台独”，声称“台湾是一主权独立国家，其主权领域仅及于台澎金马与附属岛屿；台湾，固然依目前宪法称为中华民国，但与中华人民共和国互不隶属”。
2000年 3月上台后，陈水扁鉴于民进党实力有所增长，于 2002 年 8月 3日抛出了“台湾、中国，一边一国”的谬论，彻底暴露了“台独”真面目。
台联党与建国党2001年 8月 12 日，以李登辉为“精神领袖”，以延续“两国论”分裂路线为宗旨的“台湾团结联盟”（简称“台联党”）正式成立，并在2001年底“立委”选举中获得 13 个席次，成为“立法院”第四个政党。进入“立法院”后，为抢攻岛内“急独”票源、主导台湾政局走向、阻挠两岸关系的发展，“台联党”一再抛出各种“激进台独”主张，逐渐成为岛内“激进台独”势力的总代表。
在 2001 年底“立委”及县市长选举前仓促成军的“台联党”，由于缺乏根基，整体实力比较薄弱。根据岛内各种民意调查机构所做的调查显示，“台联党”自成立后，政党认同度一直维持在 2…3％ 之间，有关政党形象的各项指标认同也一徘徊在 2％…3％之间。民意调查同时也显示，“急独”选民是“台联党”的主要选票市场，“缓独”选民是次要选票市场，且大多为 50 岁以上的闽南籍选民；40岁以下的年轻族群以及主张急统、缓统及维持现状的选民多不支持台联党。“台联党”虽然在 2001 年底“立委”选举中获得 7。76％的选票，但在接下来的基层选举中却成绩欠佳，如在 2002 年初的县市议员及乡镇市长选举中只取得 7个县议员席次；在 2002 年底的台北、高雄市长及市议员选举中，只在大本营高雄市获得 2个席次，提早出现泡沫化征兆。
“台联党”在 2003 年之前总共只有 102位党员。但是自 2003 年后，该党为壮大基层实力，已开始积极招募党员，据说目前已招募到上千名党员。“台联党”主要以“立法院”党团为工作重心，以“李登辉之友会”及围绕在李登辉身边的一些“台独”组织为基层动员力量。
以维护李登辉分裂路线为使命的台联党成立后，不遗余力地推行“激进台独”路线，获得岛内外“激进台独势力”的掌声，认为其才是真正支持“台湾独立运动”的政党，“台联党”也由此取代日渐式微的“台教会”、“建国党”等“激进台独”组织，成为“激进台独势力”的总代表。
“台联党”大肆鼓吹“改国号、制定新宪”。宣称“台湾是一个主权独立国家，与中华人民共和国并存于世界；台湾现状的任何变更，都必须经由台湾 2300万人民透过公民投票决定；应改国号为‘台湾共和国’，制定‘台湾基本法；台湾的未来就是’一边一国‘，两岸关系应该是’两国关系‘”等等。“台联党”不仅在“立法院”积极推动“公投立法”，还集合岛内“台独”组织发动“台湾正名运动”大游行，要求将一切冠有“中国／China ”的社团、公司等全部改名为“台湾”，将“国号”改为“台湾国”或“台湾共和国”等等。
为防堵两岸经贸、人员交流的快速发展增强台湾同胞对祖国大陆的向心力，李登辉、“台联党”极力反对松绑“戒急用忍”、反对开放两岸直接“三通”。叫嚣“鼓吹加速三通，等同鼓吹加速统一”，两岸若要就“三通”进行谈判，必须在“国与国”的基础上进行。在意识形态领域加速灌输“台独认同”。在李登辉主政的 12 年间，为斩断台湾民众的中华民族意识，李不断在意识形态领域向台湾民众灌输“台独意识”。
下台后，李登辉更是不遗余力地鼓吹台湾应加速培育台湾民众的“建国意识”。李登辉声称，当前台湾最大的危机在于“国家认同”出现混淆，“要摆脱一个中国的纠缠，台湾内部必须有认同台湾的国家意识”。李登辉、“台联党”还鼓吹要彻底在思想、文化上与中国划清界线，鼓动“教育部”全面扬弃过去中小学史地教材的“大中国”观点，并要求在中小学推广乡土语言教学，将闽南话列为“第二官方语言”等等。