忠高士”称号，领文官正五品俸禄，另外还将红胪场的旧所赐给他作为宅地。后又接他进入宫中，令他专门炼丹，“点物成银”。
段朝用突然由一个流浪街头的术士变为宫中皇帝的红人，好不得意。到了宫中，他与陶仲文臭味相投，故意让陶仲文测算卜卦，选择点化的方位和宫殿，制造一种神秘气氛。陶仲文因为预测卫辉大火有功，嘉靖皇帝以为他比邵元节更胜一筹，对他言听计从。段朝用便对陶仲文说建炼丹炉需要银子一万两，陶仲文找到皇帝一说，凭旨到国库领取。以同样的方式，段朝用以炼出“仙银”为名，先后从嘉靖皇帝手中掏走四万多两银子。而嘉靖皇帝在收到段朝用点化的“仙银”时，总是对它们崇敬有加，视若宝贝，根本不想想那些银两是从哪里来的，只是迷恋于段朝用炼的“仙银”和丹药。
时间一长，嘉靖皇帝感到段朝用献给的丹药并无特别之处，在曹端妃那儿，他搂着妩媚婀娜的美人，心急如焚，血涌脑门，那腿根的小东西却无动于衷。皇帝只好丢下曹美人躲在旁边偷偷服用丹药，可连服几次，也不能使他尽到性儿，急得皇帝直挠鼻子。当天晚上，皇帝便传旨，将段朝用逮捕入狱。段朝用有个徒弟名王子岩，对段朝用受宠于皇帝早有不满，段朝用事发之后，王子岩主动向嘉靖皇帝揭发了他的骗术。发现自己受了骗的嘉靖皇帝，一怒之下，将王子岩也打下了大狱。
邪说惑帝 日蚀罢相
严嵩与陶仲文互相勾结，将夏言首辅陷害出了内阁，但嘉靖皇帝并没有任严嵩作首辅，而是提升翟銮接替夏言，这对严嵩多多少少是个打击。
嘉靖皇帝识破段朝用的骗局，将他下狱，按说也是犯了欺君之罪要杀头的，但皇帝出于面子上的考虑，生怕众臣讥笑他的愚昧，大言不惭地自圆其说：“黄白之术，古昔有之。只是段朝用这人的道行太差，所以无法修炼成功。”在对待段朝用上，皇帝表现出惊人的宽容，只将“紫府宣忠高士”降为“紫府宣忠仙人”，官职降为御林卫千户。然而想到段朝用给自己带来的负面影响，嘉靖皇帝又忍不住把怒气牵至武定侯郭勋的身上。
对于郭勋，嘉靖皇帝是既可怜又可恨。他知道郭勋是礼仪派大臣，应该保护，但他接连上奏的几件事都在朝廷中造成不良影响。先是他建议恢复镇守太监，皇帝依了他，但结果却造成地方与中央的矛盾，不得不再次撤回太监。而他这次推荐的术士段朝用，更是一点用也没有，他的丹粉不但摧残了皇帝的身体，他的道行更使皇帝在臣僚面前丢尽了脸面。想到此，皇帝怒不可言，谕令锦衣校官将已升为翊国公的郭勋抓捕入狱。
围绕郭勋被抓之事，朝中大臣之间又产生了分歧。夏言虽然过去与郭勋有芥蒂，但出于公道他还是极力为郭勋辩护。因严嵩状告他对皇帝赏赐的“沉水香冠”不珍惜，皇帝对他本已不满，如今他为郭勋辩护，更让皇帝恼怒不已，他的首辅地位已岌岌可危。这时的严嵩，便成为嘉靖皇帝唯一信赖的人，而他在初任礼部尚书时向皇帝推荐的咸宁侯仇鸾两征安南，大胜而归，最终使安南臣服于朝廷，也让皇帝十分满意。嘉靖二十年（公元1541年）四月，皇帝诏改安南国为安南都统使司，授莫登庸为都统使。南方从此安定下来。对于嘉靖皇帝来说，真正的心腹之患在北方，鞑靼各部落屡犯边境，使皇帝一听就心生烦躁，祈望道教天神能助他一臂之力。
这年七月，居住在西北部的俺答汗趁着草肥马壮之机，率领彪悍的骑兵团大举南犯。在大明皇宫财政空虚的情况下，边防军的给养捉襟见肘，边军在俺答骑兵的进逼下步步退让，俺答很快越过石岭关，直取西北重镇太原。鞑靼吉襄部则由平虏卫入掠平定、寿阳等处。太原、平定、寿阳皆在京城西南，很容易对北京形成包围之势。那小小的吉襄部族为何能如此顺利地占据明廷的大片领土呢？
原来，身为边陲重镇大同左卫指挥使的王铎，多年与鞑靼另一部族首领吉襄勾结，将明廷大量的军事机密泄露出去，同时还暗中派自己的儿子王山携礼带金贿赂吉襄。吉襄为了报答王氏父子，将本族最漂亮的美女送到大同，赐予王山为妻，这样，王家父子实际上已成为吉襄在明廷的间谍。这次吉襄能够长驱直入地深入到中原内地，就是王山提供的情报。大同官兵为此事而纳闷，经过密切侦察，终于怀疑到王家父子。这天，王山悄悄潜入沙锅村刺探军情时，被村人陈九龄盯梢，并告之当地驻军。驻军出动五百精兵将准备抢劫村庄的吉襄犯贼围捕。喜讯报奏朝廷，皇帝异常兴奋，并认为这是自己长期祭祀天神的结果，是神仙帮助明军擒住了众贼。
俺答和吉襄部抢掠一段时间后，得知内应被捉，失去情报来源，连吃败仗，最后不得不派使者到大同，想通过驻军首领向朝廷求贡通市。嘉靖皇帝并不考虑求贡通市的利弊得失，恼怒地武断拒绝，从此西部冲突更是连绵不断。
在这危难时刻，严嵩又一次向皇帝提议将仇鸾调往甘肃。嘉靖皇帝对仇鸾已经有了深刻印象，一纸诏书应允了严嵩的提议。严嵩就是这样在朝中开始结党营私，趁机把与自己趣味相投的赵文华、鄢懋卿、罗龙文等人网罗在门下。眼下看来，阻碍他晋升的唯一绊脚石就是夏言了，他的下一目标，便是把提携他的恩人——夏言一脚踢开，自己登上首辅的宝座。
嘉靖皇帝虽然不喜欢夏言，但朝中的许多事情还是离不开他。一天晚上，皇帝派德兴去喊夏言。那德兴平常就怕夏言，知道夏言看见太监一概不给好脸色。而严嵩恰恰相反，他对各宫中的太监十分友好，老远看见就笑眯眯地打招呼，对宫中有权势的太监，更是注意重点打点。德兴出去转了一圈，不知道他到没到夏府，回到皇帝身边禀报说：“回皇上，夏言夏首辅已经安睡，奴才喊了半天没有人应答。”
嘉靖皇帝“嗯”了一声道：“天还这么早就睡了？德兴啊，你究竟找没找到他呀？”
德兴信誓旦旦地说：“天老爷在上，奴才在夏府门前喊了半天就是无人开门，倒是奴才在经过严尚书的门口时，看见他还在灯下看书哩。皇上，严尚书真是勤于国政呀，这么半夜三更的，他还在看您批的折子。他后脚就到。”
嘉靖皇帝一听，喜出望外。他是寂寞了，想在夜里找一位内阁大臣聊聊天。虽然没有找到夏言，但他却发现了严嵩的勤政，这正是内阁大臣所应该具备的品格呀！
第二天上午，天上出现稀疏的黄云，并渐渐变浓变黑，不一会儿，光芒四射的太阳慢慢被一块黑云遮住，霎时，天昏地暗，犹如夜晚。皇宫内外立刻响起了锣鼓声和敲打铜盆的声音，人们高呼着“天狗吞日啦，天狗吞日啦……”人们试图用喊声，用锣鼓声击退天狗，保护完整而光辉的太阳。
皇帝在宫里已经感觉到天气的黯淡，听到人们的叫喊，立刻跑出乾清宫，登上高台一看，果真是天狗吞日。这还了得，他旋即回到宫内喊道：“崔文，快拿香纸，天上出事了！快烧，快烧，把天狗烧退，救出太阳！”
当天晚上，严嵩带着银两夜访陶仲文。陶仲文因邵元节的关系，早与严嵩相识，再加上又一同随皇帝南巡，相处了几个月，关系很不一般。严嵩一来就对陶仲文道：“真人，你说今天上午的天狗吞日是何星象啊？”
陶仲文哪会不知道严嵩的心事，却故意反问道：“严尚书也是懂星象卜卦的人呀，你认为是何意呢？”
严嵩对此并不避讳，说道：“好，我这个半瓶子水的人就先说，不到的地方还望真人指教喔。这太阳不就是我们的天神吗？今日天神被狗所咬，不是吉象啊！哎呀，真人，朝廷是不是有欺主现象啊？”
严嵩平时喜欢穿黑色道袍，以博取皇帝的欢心，这个秘密人人知道。陶仲文略一思索说：“尚书说的极是。你看看那红红的太阳，一会儿发昏，一会儿被那一块黑云遮住。依贫道看在朝中是有人犯了君主，而且还是个黑衣大臣。”
“哎，哎，真人，你可千万别这么说，这种玩笑开不得，开不得呀。”严嵩急忙截住陶仲文的话，拿出早已备好的银两放到真人的手里说，“真人，话不能说得太明显，你只要暗示一下朝中有人欺主侵君，皇帝就会明白的。”
翌日，陶仲文果然被皇帝传去。即使陶仲文不说，嘉靖皇帝自己也有预感，这么多年修炼的神道告诉他，天上出现如此星象，很自然地彰显出朝廷有逆臣侵犯天子。皇帝在此问题上没有丝毫犹豫，立即谕令夏言致仕。
夏言面对突如其来的横祸，根本没有申辩的机会，只得黯然神伤地离开朝廷，回到乡下。
陶仲文为了迎合皇帝长生不老，修道成仙的愿望，在进行频繁的祈祀活动的同时，建议皇帝建筑大型雷殿，为了给皇帝示范雷坛的好处，他首先请求皇帝批准在他的家乡建筑一座雷坛，以供“祝圣寿”之用。
嘉靖皇帝当然高兴，他对陶仲文的任何计划都不会有丝毫怀疑。皇帝清楚地记得，在南巡回来的第二年，一场大病几乎夺去自己的性命。宫中太医用尽办法，珍贵汤药服用无数，仍然无济于事。宫中已在悄悄为他准备后事。万般无奈之下，陶仲文受命穿上法衣，在乾清宫的醮坛前做起道场。他诵经祈祷，挥剑劈邪，连续在坛前做了三天三夜的法事，皇帝竟然慢慢苏醒过来，又能喝水吃粥了。皇帝恢复健康后，对陶仲文感激不尽，把他当神仙对待，下诏说：“朕患恶疾，仰仗天仙地神，宗祧社稷，才得以康复。更为重要的是秉一真人竭忠尽诚，为朕祈祀。特加其少保、礼部尚书，妻封为一品夫人。”如今陶仲文奏言修筑雷殿，皇帝自然准奏，并谕批陶仲文的弟子左演法藏宗仁负责这项工程，令黄州府同知郭显文督理。后因置办工料困难，延迟了工期，嘉靖皇帝将郭显文谪为边远县城的典史，而另派工部侍郎何成前去督办。陶仲文后来一想，将雷坛建那么远，皇帝哪能跑到那儿去祭祀呢？他怕皇帝责怪，又鼓动皇帝在北京太液池之西修建佑国康民雷殿。这也是一项耗费资财的大工程。但皇帝听说建成后，能借助雷声将人间的愿望传给天帝，又眉开眼笑，欣然同意。
朝廷大臣听说皇帝将要耗费巨资建造雷殿，又是一片抽气之声，但迫于皇帝的威慑，大多数臣子敢怒不敢言。工部员外郎刘魁欲加谏阻，而且他知道上疏反对必得重祸，于是先买好棺材以备不测。刘魁给皇帝上疏道：“现在顷泰享殿、大高玄殿等工程尚未竣工，宫中的财政又告急，一年才收入几个钱呢？一次工程就要动用亿万银两。土木衣文绣，匠作班朱紫，道流所居拟于宫禁。国家的用度已经耗尽，民力也已经枯竭，却还在做一些无益的事，这样怎么能给后世以垂范呢？”
嘉靖皇帝看见此疏，恼羞成怒，当即令刑部打手杖罚刘魁于阶下，并将其逮捕入狱。
陶仲文听闻朝廷大臣谏阻建筑雷殿的风声，很是担心，他怕皇帝改变主意，自己就会一事无成。于是与严嵩勾结，鼓动皇帝排除异己。那严嵩是在陶仲文的帮助下，才将仕途上的绊脚石夏言搬掉的，对于陶仲文的要求哪里敢拒绝？他在皇帝面前大肆赞扬雷殿的好处，说皇帝建地坛为天下带来了丰收，再建雷坛，将雷神爷也供起来，请它向天神传达皇帝的心声，有什么不好呢？嘉靖皇帝听了，更加坚定了自己的决策，对杨最、杨爵、刘魁等人相继阻谏修玄之事重重责罚，毫不留情。从此以后，内外官员对皇帝醮斋焚修之事再也不敢指责了，都争相崇道拜神，以取悦皇帝。
嘉靖皇帝以自己的铁腕排除了建造雷坛道路上的障碍，放开手脚实施计划。按照陶仲文的设计，雷殿是连接天地的轴心，所以其基础要通往地心。嘉靖皇帝别出心裁地命令道，铸造一件周长为七尺七的圆铁柱，再用七七相乘，得出其长度为四十九尺。三十尺入地，直达地心，其余部分则接入上天。
浩大的工程开始了。成千上万的民工集中到太液池，昼夜不停地开挖地基。因基础离池水太近，挖掘不到一人高时，地下的泉水就直往上涌。因当初设计时没有考虑到排水设施，不一会儿那裹挟着泥土的水浆把民工淹没了，民工们只好浮出水面，想法排水。
陶仲文来到现场，看见满脸怒气的民工，心里惧怕，双腿打颤。他用手搅着混浊不堪的泥浆，眼珠子一转，说民工触犯了蛟龙，雷殿基础的泥土不应该用铁锹挖掘