交错排列的方式与 G 型正好相反，但是从波音的第 75 批次开始就与 G 型排列相同了。颚部炮塔和颊部机枪的联合配置首先在一架 B…17F…115…BO 42…30631 上进行了彻底测试。
现在 B…17G 的防御火力不少于十三挺 12。7 毫米——颚部炮塔两挺、两挺颊部机枪、背部炮塔两挺、腹部炮塔两挺、腰部机枪两挺、尾部两挺，顶部无线电报员一挺。
B。V。D。的三个成员都生产了 B…17G，其中波音的批次号从 1 到 110，道格拉斯的批次号从 5 到 95，洛克希德威加分部的批次号从 1 到 110。
1943 年末，B…17G 进入第 8 和第 15 航空军服役。1944 年 1 月，新出厂的 B…17G 开始取消涂装，对应的批次是：波音的 G…35…BO、洛克希德…威加的 G…20…VE、道格拉斯的 G…35…DL。这些飞机裸露着银光闪闪的铝制蒙皮投入作战，一方面可以减少工时，另一方面是因为德国空军已经很虚弱，盟军飞机在涂装上的重点是快速、容易地进行空中识别。
绰号“夏延”（Cheyenne）尾炮塔从 B…17G…80…BO/…45…DL/…35…VE 批次的飞机中引入。新的炮塔配备了反射式瞄准具而不是以前的圆圈准星，由于更换了尾炮塔，这些 B…17G 比早期型短了 12。7 厘米。B…17G 后期型中，腰部机枪窗口也交错排列，防止左右炮手互相干扰。
在最后的批次中（B…17G…10 5至 …110…BO、B…17G…75 至 …85…DL、B…17G…85 至 …110…VE），去掉了无线电操作员的机枪，这样使腰部机枪的弹药增加到 600 发。
1945 年生产结束时，波音生产了 4，035 架的 B…17G，道格拉斯生产 2，395 架，洛克希德…威加生产 2，250 架。波音生产的最后一架 B…17G 在 1945 年 4 月 13 日交付。
B…17G…1…VE 42…38940 用于测试用途，型号改为 XB…17G。
B…17G 性能规格表
发动机：4 具赖特 R…1820…97“旋风”星型发动机，配备通用电气 B…22 涡轮增压器，起飞功率 1，200 马力，高度 7，620 米时 1，000 马力，短时间内紧急功率可达 1，380 马力（8，138 米）。
性能：最大时速 423 公里（7，620 米）/483 公里（9，144 米，紧急功率），巡航时速 241 公里（7，620 米），着陆时速 145 公里。初始爬升率 274 米/分，爬升至 6，096 米高度耗时 37 分，实用升限 10，668 米。最大航程 2，977 公里（载弹 1，814 千克，7，620 米高度，载油 10，636 升）。
重量：空重 14，842 千克，正常起飞重量 24，948 千克，最大起飞重量 32，659 千克。
燃料：正常燃料容量 9，538 升，携带了额外油箱后总燃料容量 13，671 升。
尺寸：翼展 31。63 米，全长 22。78 米，全高 5。82 米，翼面积 131。92 平方米。
军械：13 挺 12。7 毫米，颚部炮塔两挺，颊部机枪两挺，机背炮塔两挺，腹部炮塔两挺，无线电操作员一挺，腰部机枪两挺，尾部炮塔两挺。短航程最大载弹量 7，983 千克。
皇家空军的堡垒 III
有 85 架 USAAF 的 B…17G 援助英国，英国空军称之为堡垒 III。其中的首批 30 架是由波音生产的，其余都是洛克希德…威加生产的。英国空军序列号如下：
HB761…HB790（波音）
HB791…793、HB795、HB796、HB799…803、HB805、HB815…820、KH998、KH999、KJ100…127、KL830…837（威加）
依循惯例，一部分堡垒 III 进入被空军海防总队服役，拆除了颊部机枪和腹部炮塔，并在腹部炮塔的位置安装了搜索雷达。在反潜任务中通常挂载十二枚 181 千克反潜炸弹或十六枚 113 千克深水炸弹。
1944 年 2 月，堡垒 III 进入轰炸机司令部的第 214 中队服役，基地位于斯克尔索普（Sculthorpe）。第 214 中队和基地位于奥尔斯索普（Oulthorpe）的第 223 中队一起编入第 100 大队，他们装备的堡垒 III 专用于干扰敌人防空雷达。除此之外，还经常参加英国空军的夜袭，任务是投放金属干扰丝干扰敌方雷达或作为佯动兵力迷惑敌夜间战斗机。1945 年 7 月，两个中队解散，剩余少数堡垒 III 用于气象侦察。
欧洲战场的 B…17
1942 年 1 月，第8航空军在佐治亚州萨凡纳（Savannah）创建，同年 2 月第 8 航空军番号改为第 8 轰炸机司令部，23 日先头部队移师英国。第 8 轰炸机司令部主要担负对德国目标的白天轰炸任务，在二战中装备过 B…17、B…24、B…25和 B…26 等轰炸机。1944 年 2 月 22 日，第 8 轰炸机司令部又重新改回第 8 航空军的名称。
在对德轰炸问题上，USAAF 坚持进行白天高空轰炸，B…17 的防御火力被认为足够来对付德国空军的战斗机，而英国空军奉行夜间轰炸战略。
1942 年 7 月 1 日，USAAF 的首架飞行堡垒（B…17E 41…9085）飞抵苏格兰普莱斯威克（Prestwick），1942 年 8 月 17 日，第 97 轰炸机大队的 18 架 B…17E 进行了对欧洲大陆的第一次空袭，目标是法国卢昂…索特威尔（Rouen…Sotteville）的铁路调度场。其中 12 架实施了轰炸，其余 6 架在法国海岸上空佯动。第 8 轰炸机司令部司令艾拉。埃克（Ira Eaker）准将亲自坐镇 B…17E 41…9023“美国佬”（Yankee Doodle）号参与行动。轰炸机编队由英国空军的喷火战斗机护航，没有遇到德国空军拦截。
8 月 19 日，24 架飞行堡垒参与了对法国境内的德军阿布维尔（Abbeville）机场的轰炸，这是一次为了支援加拿大军队在迪耶普（Dieppe）登陆的行动，所有飞机安全返回基地，但是在迪耶普的盟军全军覆没。接下来的十次轰炸行动都很顺利，损失两架飞机。
由于欧洲天气恶化，而且北非战事吃紧。第 8 轰炸机司令部作战计划有所改变，大多数的 B…17 都准备用来阻止隆美尔的攻势，其中最富经验的两个轰炸机大队：第 97 和第 301 大队作为新组建的第 12 航空军的核心投入到“火炬行动”中去。1942 年 9 月 20 日，杜立特将军赴英国上任第 12 航空军司令，10 月初，第 8 轰炸机司令部的第 97、99、301 和第 2 轰炸机大队都被转移给第 12 航空军，对欧洲大陆的轰炸被放到次要地位。
1942 年 10 月，空虚的第 8 轰炸机司令部将注意力集中到法国沿岸的的德国潜艇坞上，这些潜艇坞由厚厚的钢筋混凝土构成，普通炸弹对它没有什么效果。由于天气原因，许多炸弹由于无法瞄准目标而炸偏，对这些船坞的袭击没有多大战果，飞机和机组却遭受了损失，看来对付潜艇威胁的最好办法还是在海上予以歼灭。
1943 年 1 月 3 日，第8轰炸机司令部引入先导机概念，轰炸机编队中设立一架先导机，编队中的所有投弹手必须跟随先导机投弹，改变了原先自由投弹的做法。通常先导机内安排有技术最精湛的投弹手，所以这种战术能达到较好的精度。
北非作战成功后，USAAF 恢复了对欧洲大陆的轰炸。1943 年 1 月 14 日，盟军在卡萨布兰卡召开会议，确定了美英两国对德战略轰炸的总方针：英国皇家空军专事夜间轰炸，目标定为“不加限制”的德国城镇；美军以 B…17 轰炸机为主力机型的第 8 轰炸机司令部进行白天精确轰炸，目标是军事设施，并以摧毁德军潜艇的支援设施为首要目标，因为该潜艇直接威胁着盟军的大西洋运输线。1943 年 1 月 27 日第 92、303、305和第 306 轰炸机大队的 B…17F 首次轰炸了德国境内的目标——威廉港的潜艇建造设施，其中 3 架被 Fw 190 战斗机击落。
在 3 月 18 日轰炸德国威格萨克（Vegesack）的不来梅。伏尔康（Bremer Vulkan）造船厂的行动中首次使用了自动飞控装置（AFCE），AFCE 连接诺顿投弹描准器和自动驾驶仪，在投弹的最后阶段接管飞机控制。德国战斗机进行了顽强抵抗，但行动缺乏协调。
1943 年 4 月 17 日，不来梅（Bremen）的福克。沃尔夫（Focke…Wulf）工厂遭到 115 架飞行堡垒的轰炸，德国空军竭力迎战，有 16 架 B…17 没有返回，创下了开战以来最高的战损率。这只是个开始，德国战斗机的防御开始变得更加有效和协调，轰炸机的损失率经常超过 10％，尤其是当飞行堡垒前往超出护航战斗机飞行半径的地点时。在研究了 B…17 的弱点后，德国战斗机开始采用迎头攻击的战术。这项战术据称是德国空军欧根。梅耶（Egon Mayer）中尉首创的，他注意到 B…17 的前向防御火力很薄弱，背部炮塔和机鼻机枪都存在着无法覆盖的盲区。B…17 在机鼻匆忙增加了附加机枪以增强前向火力，但实际上 B…17 对来自前方的供给缺乏装甲保护，这一缺陷更致命。另一个头疼的问题是，B…17 被高射炮或加农炮弹击中后容易起火，但这一问题从未得到真正的解决。
1943 年 6 月，著名的“孟斐斯美女”号成为第一架完成 25 次机组任务配额的飞行堡垒。6 月 13 日，在基尔军港的空袭中，出动轰炸机 228 架，损失 22 架，其中尚不包括那些免强返航后报废的飞机。
USAAF 下一阶段的对德空袭目标的重心是摧毁德国的航空工业，其中的一项关键策略就是破坏德国的滚珠轴承工厂，因为差不多在任何机器的可动部件中都必须用到滚珠轴承。1943 年 7 月 24…31 日，第 8 轰炸机司令部持续高强度轰炸了 16 个主要的工业目标，8 月 17 日，又同时轰炸了施韦因福特（Schweinfurt）的滚珠轴承厂和雷根斯堡（Regensburg）的梅赛施密特工厂。这是开战以来最深入德国本土和出动 B…17 数量最多的行动，双方为此展开了激烈空战。空袭分两次进行，第一波 146 架轰炸机于当天上午飞向雷根斯堡，机群刚飞越荷兰海岸线，即遭到 Fw 190 拦截。但是德机并不急于开火，而是稳稳地跟在后面。当美机编队即将进入德国领空、护航的 P…47 和喷火战斗机到达燃油极限不得不掉头返航时，Fw 190 才一齐开火，仅在埃菲尔（Eiffel）地区上空，就击落 B…17 飞机 4 架。待这些 Fw 190 弹尽开始返航时，Bf 109 便又接火开始新一轮攻击。完成轰炸的 B…17 飞往北非降落，补充燃料和弹药后顺道轰炸了法国波尔多（Bordeaux）的福克。沃尔夫工厂返回英国，第一波共损失飞行堡垒 24 架。下午出动的第二波遭遇更惨：229 架轰炸机在飞过荷兰河口上空失去 P…47 掩护后，旋即遭到德战斗机的攻击。这次行动中的 376 架轰炸机，有 60 架末归，战损率高达 16％。这星期中 USAAF 损失了超过 100 架的 B…17，如果按照这个速度继续下去，第 8 轰炸机司令部不久就会消失。
1943 年 8 月到 9 月间，新型的 B…17G 抵达英国，新的颚部炮塔增强了前向火力。9 月 6 日，超过 400 架轰炸机轰炸了斯图加特（Stuttgart）的 VKF 滚珠轴承工厂，由于云层的阻挡，编队没有发现目标，炸弹被盲目投放在市区。总共有 45 架轰炸机被战斗机和高炮击落。10 月 14 日，B…17 再一次拜访了施韦因福特，291 架飞机损失了 60 架。
1943 年末，面对骇人的损失和可怜的战果，USAAF 被迫重新考虑继续白天轰炸是否值得。邱吉尔从未相信过白天精密轰炸，并且建议 USAAF 跟英国空军一道开始夜袭。尽管对德国航空工业进行了狂轰滥炸，但是飞行堡垒遭遇的德国战斗机的数量却有增无减。德国航空工业的恢复能力令人惊异，高效率的德国工人和大量被强迫劳动的战俘能在几天内修复损伤并使破损的工厂重新恢复运转，除此之外，武器部长艾伯特。施佩尔（Albert Speer）实施的疏散计划也功不可没。
USAAF 决定继续进行白天轰炸，但是无护航深入德境的轰炸行动被极大缩减。在 1943 年最后的几个星期中，第 8 轰炸机司令部将任务限定在护航战斗机航程可及的范围之内，不再冒险穿越。
尽管损失惊人，USAAF 还是决定继续轰炸德国工业设施。1943 末，美国战略航空军在欧洲成立，卡尔。斯帕兹（Carl Spaatz）中将任司令。战略航空军将担负起指挥从英国和意大利基地起飞的对德轰炸行动，并与英国空军的夜间轰炸相协调。
直到 1943 年末，大量装备了共和 P…47 雷电和洛克希德 P…38 闪电战斗机后，B…17 才有了有效的护航战斗机。这些战斗机能将护航范围延伸至汉堡一线。结果，轰炸机的损失马上明显下降。如 9 月 27 日对爱