撒马耳干的能工巧匠，在整个东方都是很有名的。他们生产出交织银丝的织物，生产著名的“撒马耳干织品”，生产出供整个中亚的商人使用的帐篷。
在锅商区内还出售各种铜器和精制的酒具。鞍具商区出售各种皮革马具，从喀什噶尔到设拉子，人们常常是争相购买来自撒马耳干的产品。
由撒马耳干的工匠们生产出来的一种“布浆纸”更加有名。它取代了当时穆斯林各国原来使用的纸莎草纸和羊皮纸，在工艺落后的那个年代里，这种布浆纸风靡世界，成为推动文化事业发展的重要商品。
因此，撒马耳干是中亚地区的文化中心，在一个相当长的时间内，被人们看作是中亚的文化发祥地。
随成吉思汗西征的耶律楚材，曾在撒马耳干停留很长时间，他以“河间”为名写下了不少脍炙人口的诗篇。
有不少诗中赞颂了撒马耳干这座美丽的城市，在诗中，耶律楚材激动地写道：
绿苑连延花万树，碧堤回曲水千重。
谁知西域逢佳景，万顷青青麦浪平。
可是，经历了这次战争之后，繁荣美丽的撒马耳干不复重见了，它遭到了极大的破坏。
其后，同是这位耶律楚材，又满怀悲怆，写下了《西域河中十咏》，其中诗云：
寂寞河中府，
生民屡有灾。
避兵开邃穴，
防水筑高台。
……
寂寞河中府，
颓垣绕故域。
城瑝连畎亩，
市井半丘坟。
西行万余里，
谁谓乃良图。
……
为了厉兵秣马，养精蓄锐，成吉思汗在撒马耳干境内度过了夏天和秋天，然后任命当地伊斯兰教长老的两个朋友为撒马耳干的知事和总督，派一个名叫帖布迈特里卜的蒙古人担任监督，治理当地的居民，管理全城的事务。
正当谟罕默德君臣、父子们在阿姆河西南岸的雷什特城，为抗击蒙古人一事在争论不休时，蒙古的骁将者别已经率领第一支追击部队，来到了阿姆河北岸，准备渡河了。
阿姆河流经这个地区时，河面时宽时窄，此时正是秋末冬初的九、十月份，也是涨水的季节。
者别沿着阿姆河岸走了一段路程，便选定在班加普渡河，可是，此处既无舟楫以渡水，也无桥梁以渡河，怎么办呢？
他向河岸不远处的一个山坡看去，只见那里绿树森森，不见天日，者别的眼睛顿时亮了。
他立即命令兵将们伐木编筐，内置辎重器械，外裹牛羊兽皮，使之可以浮于水上。然后把皮筐拴在马尾巴上，赶着战马泅水过河。将士们可以抓住皮筐紧紧跟随在后面，就这样，一万人马很快地渡过了阿姆河。此时，大将速不台的兵马也赶上来了，两支兵马合在一处，登上阿姆河南岸，继续向南追去，不久，大军抵达巴里黑城。
城内的守将深受谟罕默德畏敌怯战情绪的影响，为了保住自己的身家性命，主动向蒙古的军队投降。他们组织了一个代表团，携带着许多礼物，特别是进献了许多食品和钱币，欢迎蒙古军队进城休息。
者别和速不台根据成吉思汗“对归顺者可予奖励”的原则，对城里居民没有伤害，只给他们派了一名“沙里纳”，负责管理这个城市。然后又从城里找了一名向导，派一名将领作先锋，继续追击谟罕默德国王去了。
原来，者别等在接受追击谟罕默德的命令时，成吉思汗曾命令他们沿途不得围城，不能拖延和贻误追击的任务，一切都要服从追击谟罕默德的目标。
接着，者别、速不台的兵马便进入呼罗珊地区，经过连续几天的奔驰，他们来到了尼沙不儿城下，派人把城内主事的人找来，向他们面交了成吉思汗的公告。
这公告是用维吾尔文写的，上面说：“远近各地守将、领主和百姓须知：老天爷已经派我主管这个从东到西的大帝国。凡是臣服于我这个大帝国的人，都可以免于死亡，凡是胆敢抵抗我蒙古大军的人，连同其妻儿家小及全体属民，全将成为刀下之鬼。”
者别与速不台拿着这张咄咄逼人的公布，因而也就拥有生杀大权。不过，为了避免耽误追击行程，他们没有攻城，然后兵分两路，继续去追击谟罕默德去了。
后来，速不台的队伍到达哈维地区展维城时，城上的守将领着士兵敲着战鼓，高声大骂：“鞑子兵人人该杀，个个该死，你们绝无好下场！你们到处杀人放火，破坏文明，是一群该诅咒的魔鬼！”
速不台的兵马立即开始攻城，连续打了三天，才攻破城，然后屠城焚烧，全城军民无一幸免，死尸遭焚后，腥臭数十里外。
者别、速不台的大军每到一地，坚持对反抗者进行报复，然后掠取粮草和衣服，并将当地的良马、牲畜驱赶着，继续前进，一直到达刺夷城，两支人马才得以会师。
后来兵至乌达城时，者别、速不台派人去城里索求粮草，但是，城内居民关闭了城门，不理睬他们，拒绝供应任何东西。由于急着追击谟罕默德，没有在那里停留，大军便驰马而去。乌达城的居民见蒙古军队已经走远了，便在城上敲锣打鼓地庆贺自己的胜利。
者别与速不台得知这一信息，十分恼火，以为这是对蒙古大军的不敬之举，便领兵返回，将云梯架到城墙上，一鼓作气把乌达城攻下来。
为了惩罚那些人，蒙古军队一气之下，把全城居民全部杀掉，忠实地执行了成吉思汗的训令：对那些流露出不屈服和反抗情绪的人，一举消灭掉。
这次杀戮像是一个大地震，震撼了整个呼罗珊地区，听到这个消息，人们无不恐怖失色。
于是，蒙古追军迫近的消息，很快传到了谟罕默德的住地，他急忙收拾行囊准备逃跑。
此时，谟罕默德早已离开雷什特，在里海南岸的吉里阳住下来，每天都到礼拜寺去，做五次祈祷，让教长为他诵诺古兰经。
为了躲避蒙古人的追击，谟罕默德又从吉里阳转移到里海的一个小岛上。
谁知者别与速不台得到消息，以为是谟罕默德躲在哈伦堡，便不顾跋山涉水，终于来到了哈伦堡，将秃儿根可敦等全部俘获，并立即派兵马将她们送到成吉思汗那里。
后来，谟罕默德得知母后被捉，几个幼子死于刀剑之下，女儿被成吉思汗赐给了他的儿子，嫔妃们遭到士兵们的凌辱，这位国王当即神智错乱，昏迷了过去。
等到他醒来时，一直泪流不止，连饮食也忘了，不久便卧病不起了。这时候，他躺在病床上，仍在眼泪汪汪的忏悔，坚持每天祈祷五次。但是，尽管后悔，也无助于复国，更不能阻止蒙古人来追杀他。
公元一二二一年的七月，谟罕默德因患病，加上亡国之悲，哀恸而死，死后便草草埋葬在这个小岛上。
不过，谟罕默德在临死之前，终于决定，废去软弱无能的斡思剌黑，另立勇敢的札兰丁为国王，亲解佩刀，系于札兰丁腰间，命令儿子们立誓效忠于札兰丁，这一决定，不失为亡羊补牢之举——尽管为时已晚。
者别、速不台领着人马，一路招服，昼夜穷追，终于得到谟罕默德已死的确实信息，二人商议之后，便决定回师。
不料，成吉思汗又传来命令道：“里海北面有钦察部，当年曾收留过蔑儿乞人的溃卒，望你们速往征讨，不必班师。”
于是，两人不好违令，只得重整兵马，又向西北方向继续驰去。他们的队伍绕过里海，来到太和岭，只见山峦重叠，无路可走，便命令士兵凿山开道，勉强通过。
刚才翻过山头，正遇到钦察部头目玉里洁以及河速、撤儿柯思等，领着人马来阻止他们入境。
者别与速不台商议以后，便乘机向玉里洁的军队发起了猛扑。
玉里洁的军队吓得惊慌失措，他们的部队正想回头反抗时，不料人头已经落地了。
蒙古的骑兵善长在野战中的拼杀，玉里洁的前队尚处在莫名其妙之中，等到弩箭飞来，长枪戳入，才知道敌人杀来。
正想弯弓拔箭，人头早已落地，顿时慌作一团，只好拍马扬鞭，四散奔逃去了。
玉龙杰赤是花剌子模国的旧都，因此又称为花刺子模城，它位于咸海南岸，横跨阿姆河。
由于这里地处阿姆河流入咸海的三角洲附近，便形成了一个肥沃的绿洲，加上布局巧妙的渠道系统，使这块本是沼泽和沙漠互相侵袭的荒凉地区变成了拥有大片肥田沃土的绿洲。
这座花剌子模的旧都城，是当时中亚伊斯兰教的中心，据史书记载：它是世界众王子的宝座所在，人类诸名人的驻地……你期望的一切，精神的，物质的，都在其中。
因为城跨阿姆河两岸，沿河是绿色的田野，两岸芦苇丛生，湖泊遍布，水路四通八达，再远便是沙漠所包围了。
从地形上看，这里不利于蒙古骑兵的机动作战，是个易守难攻的城市。
自从谟罕默德的母后秃儿根可敦走后，城中没有留守这座旧都的将领，立刻陷于一片混乱之中。
公一二二○年的春天，花剌子模的名将守卫忽毡城的帖木儿灭里冲破蒙军的重重包围来到玉龙杰赤，立即整顿军备，组建了一支守卫队伍，使旧都的秩序才安定下来。
谟罕默德死后，札兰丁兄弟们以及众多的将领，又从里海的小岛上逃回玉龙杰赤，全城军民见到新继位的国王与亲王将领们回到了旧都，大家无不欢喜异常。
大将帖木儿灭里主动向札兰丁建议说：“立即整顿兵马，加固防御工事，准备抗击蒙古人的来攻。”
札兰丁听后，连连摇头说道：“谈何容易！城里的兵马能听从我的指挥？”
原来，玉龙杰赤已汇集了九万余人的军队，但是这支军队掌握在前太子殿下斡思剌黑及其母舅不只一别黑列旺等人手中，他们多是康里人出身，早就与札兰丁不和，开始他们与秃儿根可敦合谋，立札兰丁之弟斡思剌黑为太子，想利用这个太子的软弱无能，进一步实现他们的野心。
谁知谟罕默德在临死前废掉前太子斡思剌黑，改立札兰丁为国王，这完全出乎他们的意料之外。
札兰丁意志坚强，武艺出众，又有才能，自然不甘心大权旁落，这对以不只一别黑列旺为首的康里人将领十分不利。
于是，他们密谋杀害札兰丁，然后再让前太子斡思剌黑复出，得以继续掌握军权。
面对康里人众多的将领，帖木儿灭里也觉得棘手，二人苦苦思索着夺取军队的机会。好不容易争取到了五千人。
次日帖木儿灭里领兵出城，向哥吉干城进军时，他马上就觉得这些康里人出身的士兵，因为平日养尊处优，缺乏训练，怕苦怕累，纪律松弛，战斗力一定极差。
凭着多年带兵的经验，帖木儿灭里利用行军的空隙时间，通过言传身教，真情感染，很快团结了军中的大小头目，才使这五千人马慢慢走上正规，成为一支像样的队伍。
正当帖木尔灭里准备用突然袭击的方法，攻占哥吉干城时，札兰丁派人送来了不好的消息，使这位智勇双全的将领十分恼恨起来。
原来，帖木尔灭里领着五千兵马前脚刚走出玉龙杰赤，不只一别黑列旺便立即召开会议商讨暗中杀死新国王札兰丁的办法。不料“门外有耳”，他们的谈话被一个护卫听到了，此人大吃一惊，他心里说：“新国王是我的救命恩人，我应该立刻去向他报告，好让他有个准备。”
这个护卫名叫尤底功曷，有一次被毒蛇咬伤，无人过问，札兰丁知道后，亲自替他用刀割开伤处，挤出毒液，又用烧红的烙铁去烫灼伤处，救了他一条性命。
尤底功曷知恩报恩，悄悄跑到札兰丁的寝宫里，把斡思剌黑说的，准备暗杀他的计策一一说与他听，又叮咛道：“这可是千真万确之事，绝不能大意啊！”
札兰丁听后，想了一会儿，觉得帖木儿灭里又不在自己的身边，兵马被不只一别黑列旺独自控制着，又没有力量跟他们斗，连这个空有其名的国王也当不成了，何不早走？
他见到尤底功曷在这里未走，便对他说：“你干脆别留在城里了，替我送信给帖木儿灭里，让他有个准备吧。”尤底功曷自然愿意，二人立刻计议妥当，天黑之后，他们借着夜色的掩护，骑上快马，驰出城去，各奔目的地绝尘而去。
次日，不只一别黑列旺发现札兰丁不辞而别，知道泄漏了消息，立刻怀疑是斡思剌黑所为，但是，这位过去的太子矢口否认。
不只一别黑列旺做贼心虚，暗杀札兰丁不成，反让他跑了，他担心帖木儿灭里一旦知道这事，此人更不好对付，怎么办呢？他与汪丹在守一商量，决定一不做，二不休，不如派人去把帖木儿灭里诳回来，用伏兵把他