接着，皇太极与阿敏又领着兵马，前往鞍山铁矿增援，乌尔古岱已在矿山下屯兵半个多月了。由于后金坚持用大炮轰击的办法，铁山的墙体很快倒塌了，铁骑兵冒着矢石冲上山去，经过大半天的混战、厮杀，赵家林与邱老将军等只得领着残余的矿工队伍，退回锦州方向去了。
在这斗争日益尖锐的时候，明朝政府也派了一名总兵官名叫王朝定的，坐镇朝鲜王国进行指挥。在辽阳城失守时逃出的参将毛文龙，也占据了海岛，不断地派遣辽人，暗中潜入南辽四卫进行策反，于是，明朝的官军与辽民一道，相互配合起来袭击辽南各城的八旗兵。
在较长一段时间内，辽南四卫成为朱明王朝与努尔哈赤的后金政权激烈争夺的第一线。
在额亦都与安费扬古两员大将连续去世之后，努尔哈赤仍然没有从沉痛的怀念与追忆中解脱出来，年纪尚轻的另一位大臣扈尔汉又病逝了。
努尔哈赤痛苦万分，整日哀叹不已。
范文程与众贝勒也整日陪着他在悼念死去的四位大臣，为了给汗王解忧，范文程只得陪着他下象棋，借以宽慰他那伤痛的感情。谁知不久之后，何和理也病危了。努尔哈赤闻之，急忙前去探望。
这五大臣中的最后一位大臣何和理，自从得病以来，一直高烧不退，浑身烧得滚烫，以致饮食不能进，夜夜不能寝。绰尔济医生想尽办法，也退不下他身上的高烧，病情愈加严重起来。何和理自知得了不治之症，便不由得想起了费英东、额亦都、安费扬古、扈尔汉四位战友、兄弟，时常是想着想着便哭起来了，有时竟然自言自语地说话，如此一来，病情越发加重。一天夜里在面见汗王后便咽了气。努尔哈赤不禁大声号啕恸哭。）
近四十年来，何和理紧紧跟随努尔哈赤统一建州，帮其襄理政务，筹措粮饷，打制兵器，甲杖盔械等，无不兢兢业业，事事完善。在征伐黑龙江女真、灭乌拉，打叶赫，血战萨尔浒，无不立下战功。为了战争需要，何和理为努尔哈赤组织后金谍报组织，刺探明军情报，收买明军将士，为攻陷抚顺，占领辽阳等城，均立下奇功。
这些日子里，努尔哈赤经常地叹息着说：“五位大臣走了，朕失去了‘股肱之臣’，失去了左右手。”
孙承宗上任以后，对袁崇焕十分信任，二人对辽东的防务有共同的认识，于是关系密切，十分合作。
后金自得广宁城之后，也没有派兵驻守辽西地区，加上两辽百姓处处掀起抗金怒潮，努尔哈赤不得不派兵镇压，使努尔哈赤深深感到自己兵力不足了。
由于明朝的军队也都撤进山海关内，辽西这一广大地盘一时成为无主之地，后金与明朝，双方不断派出游骑侦察，经常捕捉对方人员，发生了一些小磨擦事件。袁崇焕建议务必要守住攻守两备的军事要地宁远城。
不久，孙承宗便派祖大寿负责修筑宁远城。
可是，这位祖大寿却没有意识到筑城的重要，敷衍塞责，按照孙承宗原来订的标准，他只完成了十分之一的任务，而且质量又差。
一天，孙承宗带着袁崇焕，一起来到宁远城，察看以后，他们十分不满意。祖大寿却当着孙承宗的面，重弹“劳民伤财”之说，被他当面斥责一番。孙承宗指着地图，向祖大寿说明宁远城的重要位置，说明守住宁远，就是守住山海关的道理。
后来，袁崇焕亲自对宁远城重新设计了新图纸，规定城墙高三丈二尺，雉高六尺，城墙底部宽三丈，顶部三丈四尺。经过一段时间的辛苦修筑，新的宁远城终于竣工了，孙承宗又亲临视察，非常满意，两人一起精心布署了一条抗击后金的新防线——宁锦防线。
这条宁锦防线，是指从锦州、松山、杏山，到右屯、大小凌河等地，不仅遣将派兵把守，还对原来的城墙进行认真修缮，进驻重兵，严密防守。在孙承宗指导下，经过袁崇焕亲率军民辛苦了一年，一度荒凉凋敝的宁远，变为明朝抵御后金南犯的关外重镇。
在孙承宗、袁崇焕的“以辽人守辽土，以辽土养辽人”的战略思想指引下，天启四年（1624年，天命九年）九月，孙承宗派遣总兵马世龙偕巡抚喻安性及袁崇焕东巡广宁，历经十三山，经过右屯，又从水路抵三岔河，让都司杨朝文去盖察访。
这次袁崇焕等东巡三州两河，相度形势，察访虚实，训练了士卒，增长了胆气，实在是一次壮军威、鼓士气的举动。
自孙承宗上任以来，定军制，建营垒，备火器，治军储，缮甲仗，筑炮台，买战马，“层层布置，节节安排，边亭有相望之旌旗，岛屿有相连之舸舰，分合俱备，水陆兼施”，一时之间，警报不传，烽火熄灭，逃难的百姓又陆续返回家园，开垦屯种，一度沉寂的辽西大地，又变得生机盎然。
后金汗王努尔哈赤见到孙承宗与袁崇焕将帅一心，联手合筑宁远城，又建了一条宁锦防线，一时无懈可击，不便兴兵南来。便让大贝勒代善率领三千骑兵去攻打锦州，实施范文程的投石问路计策。
锦州的明朝将领马士龙，宁夏人，武举出身，历任游击，副总兵等职。孙承宗来山海关就任后，见马士龙勤谨职守，对辽东防务比较重视，便向皇上推荐他为总兵，并派他守锦州。
马士龙确实对锦州的防备很重视，先后修补了城墙，在认真训练士兵的同时，把城上的火炮装置妥当，带领士兵运来大量滚木、礌石，并准备了充足的粮草，还加强了军情的刺探，建立了完整的军事情报组织。
因此，大贝勒代善的兵马一出沈阳城，就引起锦州探马的注意，他们一方面派人继续监视这支骑兵的动向，一边向锦州报告。
马士龙立即登上城头，布置防备，沿城巡视，命令守军严阵以待，不可粗心玩忽职守。
得知消息后的袁崇焕早已成竹在胸，立即派遣副将左辅、朱梅二将，带领二千人马，迅速前往锦州救援。
二人走后，袁崇焕又让传令分别前往宁锦线上的松山、杏山二城，命他们也派出少量兵马前往锦州援助。
大贝勒代善的兵马来到锦州城下，一见城上早有防备，若是领兵回去，不仅被敌人耻笑，也会受到兄弟贝勒的讥讽，只得命令骑兵攻城。
顿时，城上城下喊杀声爆起，鼓声与角螺声相互应和，城上的大炮连续在旗兵中间爆炸，一排排旗兵倒在地上。
马士龙在城上指挥守军，用滚木、礌石打击靠近城下的旗兵，把那些攀爬云梯的旗兵一次次、一个个地打下去。
大贝勒代善骑在马上，指挥着他的旗兵攻城，只待城墙能倒下一个豁口，他就可以命令身后的铁骑，一马冲进城去！
猛然之间，城南方向尘土扬起，呐喊声渐渐近了，大贝勒代善不由一惊，知道是明朝的援军到了，耳畔响起父王那“打的赢就打，打不赢就走”的叮嘱。
明朝守军们见有援军到来斗志更旺，对准后金兵马猛开大炮轰击，滚木与礌石打得后金兵马晕头转向，而后金兵又看明朝援军到来，不免惊慌起来。
这时，马世龙见松山、杏山的兵马已杀向后金队伍的背后，便当机立断，把城头守卫安排已定，立即领着五百精卒，从城里杀将出来。
大贝勒代善腹背受敌，被前后夹攻，心知再不撤退，将受到包围了，遂命令停止攻城。他领着残余兵马，丢下攻城的器械，与围上来的明军混战在一起，拼命往外面杀去。
努尔哈赤自大贝勒带兵走后，总觉得心里不甚踏实，急命四贝勒皇太极迅速带兵前去增援，以防代善有失。
皇太极的兵马刚出沈阳不久，便有探马回来，要他快去救援，皇太极未等探马说完，便对座下战马连加三鞭，领着铁骑如旋风一般，沿着去锦州大道，飞速地驰去！
宁远来的救兵左辅、朱梅二将领着五百士卒，也急匆匆往锦州赶来。等他们赶到时，见后金兵马杀开血路，想往沈阳方向逃跑，左辅一边向身后士卒喊着，一边手执大刀，迎头就向代善砍去。孙梅将军领着士卒随着围前来，把大贝勒代善围在中间。
正在十分危急之时，四贝勒皇太极的兵马赶到了，在潮水一样的铁骑的冲击下，明军再也拦截不住，大贝勒代善才得已逃出重围，与四贝勒的铁骑合兵一处，往北逃去。马世龙等领着兵马随后追杀，他们用弓箭，又射杀了许多受伤的旗兵，直至天色将晚，才各自收兵回去。
代善与皇太极领着残余兵马，回到沈阳城里，一查点人数，大贝勒的三千兵马，只剩下了一千二百多人。皇太极领去的三千兵马，也损失了一百多人，兄弟二人却深感明军有了变化，再不可轻视了。
这块石子投去的结果已很清楚，对明军再不可低估它的战斗力，必须谨慎对待！
锦州反击战之后，孙承宗来到宁远城，又与袁崇焕一道亲赴锦州城里，让侍卫把从山海关带来的慰问品，立刻分发给城上守军。
孙承宗又让马世龙通知松山、杏山、右屯及大小凌河的守将，齐集锦州，举行庆功宴。
为了向皇帝报捷，为将士们请功，孙承宗在酒宴之后即写了奏表，派快马送去京城。
可是，这报捷奏章一进宫门，便杳如黄鹤，因为魏忠贤押着不报，深居皇宫、整日忙于嬉乐的皇帝怎么能见到呢？
尽管没有皇帝的嘉奖，没有来自朝廷的犒劳慰问，这次反击战的胜利其意义和影响，仍是巨大的。从山海关到锦州，广大明军将士全都受到鼓舞，提高了士气，增强了战斗力。
后金汗王努尔哈赤，自从派代善领兵攻打锦州败回，心中不服，总想伺机报复，又见孙承宗与袁崇焕二人同心协力，宁锦防线固若金汤，真是无懈可击，苦思多日，终无良策。
一日，李永芳前来向他献计，以攻取锦州为名，先占据易宗难攻的重地北石山。
努尔哈赤采纳了李永芳的计策，积极进军，明言攻打锦州，暗中却要去攻占北石山。
这一阵子，孙承宪因为那饷银被魏忠贤压着不发，报捷奏表又被他押着不报，心中郁火太盛，弄得唇焦舌烂，两眼喷火，眼珠子被烧得血红血红的，似乎随时都会流下血来似的。
孙承宗一行人刚进宁远城，迎头便撞见袁崇焕。
将帅二人，一路谈谈笑笑，来到府衙里，刚刚落座，便有探马前来报告努尔哈赤带兵四万前来攻打锦州的消息。经过商议，袁崇焕带兵马五千，告别了孙承宗，急匆匆地往松山方向去了。
锦州城里的马世龙，这些日子里也忙得够呛，因为前次反击战的胜利，全体守军士气很高，他领着士卒们修补城墙，还挖了又深又宽的护城壕沟。为了增强防守力量，搬运许多滚木、礌石，调整了炮火的位置，赶造了许多弓箭。
这一天，他正在城头与守军们一起布防，忽然听说后金努尔哈赤亲领大批兵马，又要来攻打锦州城，心中不免一惊，立即走上城头，命令守军做好临战的准备工作，并通知烽火台立即点火报警。
不久，只见通向辽沈的大道上尘土飞扬，马蹄声哒哒，后金旗兵快要到了，他急忙命令守军把四门吊桥高高吊起，准备迎战！
且说大贝勒代善、二贝勒阿敏，带着二万兵马来到城下，一声令下，兵马散开，“哗喇”一声声响过，把一座锦州城围得水泄不通。
因为天色已晚，便命令士兵埋锅造饭，饭后抓紧体息，明天攻城。
汗王努尔哈赤见已完成对锦州城的包围，又见天色将晚，便吩咐三贝勒莽古尔泰、四贝勒皇太极乘着夜色向北石山进军。
转眼之间，后金四万八旗兵马浩浩荡荡，旌旗猎猎，远远望去，宛如汹涌澎湃的大海怒潮，奔腾而去。
努尔哈赤的兵马一调头，往松山方向刚走不到半里，探马早已跑向袁崇焕报告了。
袁崇焕立即派遣左辅领兵马二千人，埋伏于松山城外东树林中，并在他耳边低声说了几句话，左辅将军领兵而去。接着，他又命令朱梅领兵二千人马，在松山城西两山谷中，也在朱梅耳边小声交待一番，只见朱梅将军也笑眯眯地带着兵马回松山城里去了。
进城以后，袁崇焕与守将孙元化合兵一处，共有一万余人，二人共同商议了守城方略，对城头的各项防御设施认真作了检查和补充。
孙承宗在宁远城里，对松山方面比较放心，以为锦州城里兵力薄弱，不过几千兵马，确实有些担心。他立即派人回到山海关，命令祖大寿领兵五千人，迅速从海上乘船支援锦州，要祖将军行动要快，不得拖延。然后，孙承宗又派出几个探马，分别到锦州、松山方面了解情况。
后金汗王努尔哈赤连夜行军，直扑北石山，天亮前，兵马已到