距离第二次忍战，已有四五年。在整个忍者都趋向于和平时，有一个人在此期间，行走于黑暗之中，行那黑暗冷血与不可告人之事之人——
志村团藏！
三代目猿飞日斩年轻时候的同伴与友人，彼此有着很深的羁绊。用现代的言语来形容的话，两人基情四溢，情到深处，你侬我侬。志村团藏在竞争火影之位失败后，借助着猿飞日斩的愧疚心理，怀着对木叶火影之位的野心组建了根之暗部。
任何组织初建之时，总是不那么顺利。志村团藏的“根”组织，历程很艰辛来的。有了火影暗部的珠玉在前，村子里谁还进入籍籍无名的“根”部？
于是，优秀的忍者都纷纷以进入暗部为荣。“根”部所能吸纳的，只有忍者天赋低下的一群人。且年纪大了，性格方面所能改变的甚少，所以根组织第一代人是失败的。不止如此，在未来的二十余年中，经历了十余代人，新旧替换，仍旧是失败的。
在这个漫长的岁月中，志村团藏终于总结出了一套属于并适合自己的真理——
隐藏、蛰伏、唾弃、鲜血、罪孽、人性……
木叶，延展向温暖的阳光之处；树根，深入黑暗的泥土之中。火影之位既然已经遥遥不可及了，那么便当一个隐藏于黑暗与幕后之人。扼杀一切影响木叶和平之人，对于木叶有威胁之人。哪怕成为双手沾满鲜血的、被人憎恶的屠夫，亦在所不惜！
至根组织的建立，到如今二十余年，团藏的心一直在变化着，摇摆着。一直徘徊于木叶的利益至上，还是木叶火影那遥不可及的掌控者的身份……
在志村团藏快要放弃之时，第二次忍战结束让他看到了希望。艰难生活在忍界的那些流离失所的孤儿们，那些在战争中牺牲的优秀忍者所留下的遗孤，拥有可怕天赋却得不到有心人引导，尚未成熟却值得改造的孩子们——
木叶的未来？
志村团藏的希望！
岁月不可复制，年纪愈见老迈。当上火影，猿飞日斩已经逐渐忘了忍者间的战斗，沉溺于所谓的木叶最强、忍界之雄的封号之中，不可自拔，固步自封……与志村团藏同属于一辈人，彼此又是一直以来的竞争者，谁又强谁多少？谁有输谁多少？
一个力争上游，继续冲刺着忍道之路，艰难的努力与进步。一个“荒废”忍学，在安逸的生活中逐渐丧失了争强好斗之心。
忍者，如逆水行舟，不进则退！
……
木叶有长老团，在木叶中有着举足轻重的地位。而木叶的长老团顾问，则是长老团的代表，在一定程度上，能够影响木叶火影的决策！
木叶顾问——转寝小春、水户门炎。
长老团中的长老，要么是木叶的老一辈强者，要么是木叶某些家族的族长或族内地位极高的一群人。水户门炎与转寝小春领衔着这一群人，完全可以称得上火影目猿飞日斩之下的第一权势之人，比志村团藏的根组织要强。
但事实上，并不是。
秘密，它之所以是秘密。并不是它无人所知，而是知道的人甚少。但，终究会有人知道，在这个世界上，没有不透风的墙。
当初水户门炎与转寝小春是如何年纪轻轻成为木叶长老团顾问的，这个秘密终是会有人泄露出去，让人知道。而泄露这个秘密的人，不是别人，正是志村团藏！
志村团藏其实也算得上是木叶的长老团顾问，但相比于转寝小春与水户门炎却要差上许多，别人可是玩政治的。尤其是，转寝小春与水户门炎虽不是夫妻，但一直以来都出双入对，相敬如宾，要说两人之间没有不得不说的悱恻故事，志村团藏打死都不相信。
志村团藏受二代目千手扉间的影响很深，一度认为由扉间所创的暗部是木叶的终极力量！可暗部属于火影，于是放弃了与小春、门炎在政治方面的争权，想要组建一支不下于暗部的根组织。
却哪里想到，长老团才是木叶最可怕的存在！
哪怕那群长老已日暮西山，远不复当年之勇，但它们不行，却不代表他们身后的势力不行。没多久，志村团藏便后悔了。但是后悔却已于事无补，如今的长老团已容不得团藏的涉入。故此，他方才坑了转寝小春与水户门炎一把，将他们拉下神坛！
这个坑，足足坑了转寝小春与水户门炎足足二十六年！
一开始，唯有宇智波与日向两族不遵从他们这两个木叶顾问的命令。可是在那个秘密被泄露之后，便有三分之一的人临阵倒戈，超过一半的人作壁上观，剩余的人也大多是墙头草，属于两头倒的人物。
这个秘密到底是谁泄露出去的？
水户门炎与转寝小春将嫌疑人锁定在了志村团藏与猿飞日斩两人的身上。而最大的怀疑对象便是猿飞日斩。见不得两人做大，威胁到木叶火影的地位，猿飞日斩实在是不做第二人选。至于志村团藏，这个二十多年来毫无建树的男人，逐渐被他们无视了。
转寝小春与水门门炎的日子过得很憋屈。木叶顾问听着的确很牛。
而且，在某些事上，猿飞日斩这个火影的确要与他们商量，听取他们的意见。但一到遇到大事，直接无视了他们的话事权，一个人专断独行，下了决定。便是明知道，却也无可奈何。没有办法，谁叫别人是火影，自己没有与之抗衡的实力呢？
志村团藏是有野心的男人。在木叶高层中，并不是一个秘密。而转寝小春与水户门炎两位顾问则是一直看在眼中，也一直无视。直到近几年，志村团藏行动日渐频繁，两位顾问大人终于发现了一个大问题——团藏的势力在做大！
在两位顾问看来，与大蛇丸暗通曲款，那不过是小打小闹。
不论大蛇丸有多么的吊炸天，拥有多么大的威胁能力，只要他们随意向猿飞日斩冒一句：大蛇丸在进行人体类的禁忌实验。那时不论猿飞多么在乎大蛇丸这个弟子，大蛇丸的结局都只有一个——被扼杀或被驱逐！
大蛇丸这一块，两位顾问大人压根儿不在意。但吸纳村外的人，融入新鲜的血液，特别是在战争过后，丧失亲人的年轻小家伙，心底那种无助与彷徨以及求生望，根组织团藏的手段培养……两位顾问大人只看见可四个字——军事力量！
不错，正是未来的军事力量。这也正是转寝小春与水户门炎现在最为欠缺的东西。作为顾问，不说贪污，单是别人孝敬的就不少，金钱早就有了，但有钱却很难花——如何充分与合理的利用，一直很困扰这对情奸恋热的男女。
终于，力争上游第三者志村团藏出现了，形成了一个三角关系。
木叶根组织基地。
这不是转寝小春与水户门炎两位第一次在这黑暗暗阴森森的地方见志村团藏了，这两年多来，三人已秘密幽会了好几次，可惜没有一次达成协议。
而这一次，本来一直未有妥协的转寝小春与水户门炎两人却不得不妥协了，其根本原因便是两人见到了第三次忍者大战爆发的机会！
事实上，想要让第三次忍者大战爆发很容易，且时间越往后，忍界便动荡的越厉害，到达了一个固定点后，宛若气球般“啪”的一声便破碎了。只是很明显，只有真正掌握忍战爆发时间的人们，方才能做好最充分的准备，获取最大的利益。
至于这个机会，两位顾问已经掌握了。
在三个小时前，他们收到了一个惊人的消息——有一位实力强大的“s”级叛忍在赏金会所接受了一个任务，刺杀风之国砂忍村第三代风影！
；。。。 ； ；
第二章 出村前夕
夜晚，明月；后院，屋顶。
树影，清风，微凉。
青瓦拱起的位置，一个丰神如玉的青年，双眸蕴灵气，黑发藏诗篇。右手揽在一个肌肤胜雪、温柔若水的美丽女子，拥在怀中，笑容阳光，一脸柔情，轻轻低唱：
“拨开天空的乌云，像蓝丝绒一样美丽。我为你翻山越岭，却无心看风景。我想你，身不由己，每个念头有新的梦境。
但愿你，没忘记。我永远保护你，不管风雨的打击，全心全意。
两个人相互辉映，光芒胜过夜晚繁星。我为你翻山越岭，却无心看风景。我想你，鼓足勇气。凭爱的地图散播讯息。但愿你，没忘记。我永远保护你，从此不必再流浪找寻。
爱就一个字，我只说一次。你知道我只会用行动表示！落叶太放肆，守住了坚持。看我为你孤注一掷！
爱就一个字，我只说一次。恐怕听见的人勾起了相思！热闹的村子，搜索你的影子，让你幸福我愿意试。
……
让你幸福是我一生在乎的事——”
一曲唱罢，羽衣秀的心情舒畅了很多。在这个家里，宇智波美琴永远是他最想要倾述的对象。一切的烦恼与忧愁，总是伴随着与她的相处而逐渐淡化，抛于脑后。
温柔、大方、贤淑……古代的三从四德在宇智波美琴的身上体现的淋漓尽致。很多时候，羽衣秀都会很“虚伪”的说：若是时光可以倒流，能够重新选择，一辈子能有宇智波美琴这么一个温婉如水的妻子就足够了。
明天打算接个出村子的任务，混个几个月回来。在此期间，他发现原来自己最舍不得的不是正牌妻子千手纲手，也不是最近常常找他麻烦的漩涡玖辛奈，而是为他生下了一个儿子的宇智波美琴。
一岁大的宇智波鼬，展现出了与常人天差地别的智慧，无愧于前世天才鼬殿之名！
至于忍者天赋，虽没有测试，但羽衣秀相信绝对不差。毕竟不论是他的血统还是忍者天赋，可比宇智波富岳强得多。
可是，基于对前世宇智波鼬遭遇的了解，羽衣秀坚信，过早的让宇智波鼬开发身体的潜能绝对是百害一利。宇智波鼬未来虽然天资纵横，但身体却患有疾病，过早的夭折。
原著中，不知是不是宇智波富岳对宇智波鼬的锻炼与锤炼，让年仅四岁的宇智波鼬就见识了忍界第三次大战的残酷，从而影响了他的一生。
但羽衣秀不会，他同样对宇智波鼬很严厉，但他严厉的是想教导他如何“做人”——为了自己的家人，别说是舍弃村子。在迫不得已的情况下，哪怕是丧尽天良亦在所不惜！
于此，导致的结果是，宇智波鼬被养成的很好，但却对他这个父亲的态度极其冷淡。
“这个地方，真的和我以前在的地方不同呢！美琴，你知道么，在我以前生活的地方啊，一岁大的孩子还在牙牙学语，十岁大的孩子还在父母的怀中撒娇。而在这里，一岁大的鼬已经有着不下于成年人的智慧了，而一般五岁大的孩子们，居然比某些成年人的身体还要强壮与充满力量……”
望月思乡不思乡羽衣秀不知道，反正现在的他禁不住感叹。
羽衣秀有时说些莫名其妙的话，宇智波美琴向来听不懂。但听不懂，她不会问，同样也不会不懂装懂，而是很巧妙的岔开话题：“秀，小鼬才一岁不到，你别对他那么严厉好不好？每次看着他用漠然的眼睛看着你，我的心都好痛。你们是父子啊——”
说着说着，美琴的眼睛就有些泛红了，弥漫着淡淡的雾气。
在她的额头前轻轻吻了一下，羽衣秀道：“对小鼬太温柔，我怕娇惯于他，使得他重蹈覆辙。对他严厉，只是为了他能更清楚的看清事实的真相，别被其他人趁虚而入。如果要恨就恨我一个人吧。正所谓‘无仇不成父子’，一切都是注定的。”
宇智波鼬出生时，羽衣秀就有一种异样的感觉。而后相处了一段时间，他曾一度怀疑宇智波鼬与他一样是个穿越者，然而在飞机、汽车、火箭、卫星等等一系列现代词汇的试探下来，羽衣秀清楚的了解到，原来是自己想多了。
宇智波美琴还想张嘴说些什么，但小嘴突然被堵住了，直到喘不过气，羽衣秀才认真的说道：“美琴，你只要知道，我这么做，只是为了小鼬好就行了！”
……
很是郁闷的从千手纲手家出来，漩涡玖辛奈愤愤不平的给小狐狸一个爆栗。小狐狸的额头，很快就肿起了一个红彤彤的大包。
“主人姐姐，你为什么打人家？”小狐�
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